Понекропостим
Если надо много погроммировать то лучше взять фпга с настоящим процессором внутри, у альтеры это цыклоны 5ые некоторые.
Ну или т.н. софт-ядро проца внутрь фпга сувать (т.е. процессор будет в этой самой фпга и сделан, скомпилирован из верилога), ниос какойнить (у альтеры), что-то и у ксилинкса есть, не знаю. Можно ещё какое-нить левое с опенкорок например, но тогда проблема отладки встанет. Из хороших вариантов последнего случая могу посоветовать openMSP430. Оно аж silicon-proven и чуть ли не в космос уже летало, и при этом открытое. Да и с отладкой там намутили вроде что-то.
Переводить код ц-цхх на верилог -- это имхо профанация, для простейших вещей может и прокатит, для сложных -- нет или кол-во гемора превысит разумные пределы.
Ну и наконец, я взял и запаял (ткфп 0.5мм) фпга лет 10 назад, и прошивку написал, всё ок было. Плату переделывать не пришлось даже